Accanto ai collegi storici e alle fondazioni riconosciute dal Ministero, Pavia accoglie anche una rete di collegi e residenze pubbliche gestite dall’Ente per il Diritto allo Studio Universitario.
IUSS riconosce il peculiare ruolo formativo dei Collegi universitari e realizza una propria forma avanzata di partecipazione istituzionale dei Collegi pavesi ai propri processi formativi e di ricerca, considerando tale partecipazione un elemento caratterizzante e distintivo dell'Istituto nel quadro delle Scuole Superiori italiane.
Grazie a questa specifica collaborazione, l'Istituto può anche assicurare una qualificata residenzialità alle proprie attività didattiche e di ricerca.
Sono partecipazioni istituzionali dell'Istituto dalla sua fondazione, i Collegi di Merito: l'Almo Collegio Borromeo, il Collegio Ghislieri, il Collegio Nuovo -Fondazione Sandra e Enea Mattei, Fondazione Collegio Universitario S. Caterina da Siena, e l' Ente gestore per il Diritto allo Studio Universitario(EDISU).